智慧生物学系
邹沁 助理教授(特别副研究员)/硕士生导师
邹沁，预聘助理教授
邮箱：zouqin@bit.edu.cn
招生方向：生物学（071000）/ 生物技术与工程（086001）
欢迎具有生物学、医学、生物信息学、人工智能等专业背景的同学加入
个人简介
邹沁，博士，预聘助理教授，主要研究方向聚焦于AI与调控元件挖掘、基因编辑、翻译组学及翻译调控。主持国家重点研发计划子课题、国家自然科学基金、河北省自然科学基金、山东省自然科学基金等科研项目近10项。在Nature Communications、Cell Research、Genome Biology等国际高水平期刊发表SCI论文近20篇，申请或授权国家发明专利近20项，研究成果获北京市自然科学一等奖。同时担任Ecological Genetics and Genomics等SCI期刊及《生物学杂志》等中文核心期刊审稿人，受聘为中国技术创业协会校企融合专业委员会专家、全国研究生教育评估监测专家库专家和国研评审中心评审专家。教学方面，主讲《人工智能与计算科学》《生命科学基础》《基因工程》等核心课程。主持或参与教研教改项目10余项，发表教改论文近10篇，获北京理工大学优秀教育教学成果奖等多项教学奖励。作为指导教师，指导学生荣获第十四届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛主赛道全国金奖，“青创北京”2024年“挑战杯”首都大学生创业计划竞赛北京市金奖，中国国际大学生创新大赛（2024）北京赛区高教主赛道北京市三等奖，以及北京理工大学2024届本科生毕业设计（论文）重点项目等多项荣誉。
教育经历
2019年，清华大学，生物学博士，导师：杨雪瑞
2012年，华中农业大学，理学学士，导师：王晓东（北京生命科学研究所所长、资深研究员、美国国家科学院院士、中国科学院外籍院士）
科研与学术工作经历
2024年至今，北京理工大学，航天中心医院，助理教授/特别副研究员/硕导
2023年至今，北京理工大学，唐山研究院，特聘副研究员/功能微生物中心副主任
2022年至今，北京理工大学，js3845金沙线路，助理教授/特别副研究员/硕导
2020年至2021年，清华大学，生命科学学院，博士后
学术任职
Nature Communications、 Cell Research、ACS Synthetic Biology、Ecological Genetics and Genomics等SCI期刊、《生物学杂志》、《合成生物学》等中文核心期刊审稿人
中国技术创业协会校企融合专业委员会专家
全国研究生教育评估监测专家库专家
国研评审中心评审专家
研究概述
主要从事AI for Science特别是原核基因组基础模型与调控元件挖掘、基因编辑、翻译组学、蛋白质翻译调控网络与机制的系统研究。通过深度学习、大语言模型等多组学大数据的整合分析，从多维度系统鉴定翻译调控因子，阐明翻译过程的调控通路，从而构建智能驱动的翻译调控网络。
具体包括：
1. 原核基因组基础模型与生物信息学
2. 翻译组学与蛋白质翻译调控网络
3. 高产工业菌株的转录与翻译调控解析
4. 哺乳动物细胞基因编辑与工程菌治疗
科研项目
12. 国家自然科学基金，青年项目，2025/01-2027/12，主持
11. 国家重点研发计划子课题，“前沿生物技术”专项，2024/12-2027/11，主持
10. 山东省自然科学基金，面上项目，2025/01-2027/12，主持
9. 河北省自然科学基金，面上项目，2023/01-2025/12，主持
8. 北京理工大学“青年教师学术启动计划”，2022/01-2024/12，主持
7. 清华大学-北京大学生命科学联合中心清华优秀博士后基金，2020/01-2021/12，主持
6. 国家自然科学基金面上项目，针对肝癌及结直肠癌肿瘤翻译组异常的高精度系统分析，2020/01-2023/12，66万，参加
5. 国家重点研发计划“精准医学研究”专项，结直肠癌临床样本的交叉生命组学研究和生物医学大数据分析，2016/07-2020/12，295万，参加
4. 国家自然科学重大研究计划培育项目，小鼠中组织特异性lncRNA/mRNA 异向转录基因对的鉴定及调控作用的系统研究，2016/01-2018/12，102万，参加
3. 清华大学自主科研计划，新型异链嵌合体RNA的系统鉴定与分析，2019/07-2020/06，40万，参加
2. 清华大学自主科研计划，肝细胞癌肿瘤组织内成与功能机制的系统研究，2015/03-2017/12，50万，参加
1. 清华大学自主科研计划，核糖体蛋白翻译过程的应激调控机制，2014/01-2016/12，59万，参加
发表科研文章
18 Jianing Peng, Yi-Xin Huo, Qin Zou*. The gut microbiota–bile acid axis in disease: mechanisms and therapeutic potential. (Under Review)
17 Yu Xiao, Yi-Xin Huo, Qin Zou*. Advances in Transformer and Genomic Foundation Models in Prokaryotic Genomics. (Under Review)
16 Jingyu Wang, Yi-Xin Huo, Qin Zou*. Advances and Challenges in Prokaryotic Open Reading Frame Prediction Methods. (Under Review)
15 Qin Zou*, Tingting Ding，Yi-Xin Huo*. Repeat-anchored genome architecture enables stable functional doubling. (Under Review)
14 Lingwei She, Zeyu Liang, Qin Zou*, Yi-Xin Huo. Engineering CRISPR Effector Proteins: Advances from Rational Design and High-Throughput Screening to AI-Driven Development. (Under Review)
12 李金龙,董周寰,邹沁,马晓焉,霍毅欣.基于微卫星稳定性分层的结直肠癌突变基因相关性分析[J].临床与实验病理学杂志,2026,42(01):86-92.DOI:10.13315/j.cnki.cjcep.2026.01.012.
11. Fajin Li, Jianhuo Fang, Yifan Yu, Sijia Hao, Qin Zou, Qinglin Zeng and Xuerui Yang*. Reanalysis of ribosome profiling datasets reveals a function of rocaglamide A in perturbing the dynamics of translation elongation via eIF4A. Nature Communications. 2023, 14, 553. (SCI, IF=17.694, Q1, TOP)
10. Changgeng Xu, Qin Zou, Jiheng Tian, Mengyuan Li, Baowen Xing, Julia Gong, Jiangyun Wang, Yi-Xin Huo, and Shuyuan Guo. Simplified Construction of Engineered Bacillus subtilis Host for Improved Expression of Proteins Harboring Noncanonical Amino Acids. ACS Synthetic Biology. 2023, 12(2):583-595. (SCI, IF=5.249, Q1, TOP)
9. Xiaolin Hu#, Qin Zou#, Li Yao, Xuerui Yang*. Survey of the binding preferences of RNA-binding proteins to RNA editing events. Genome Biology. 2022, 23(1):169. (SCI, IF=17.906, Q1, TOP，系统解析了RBP-RNA编辑的结合偏好性与功能关联) （#共一）
8. Yuting Wang#, Qin Zou#, Fajin Li, Wenwei Zhao, Hui Xu, Wenhao Zhang, Haiteng Deng, Xuerui Yang*. Identification of the cross-strand chimeric RNAs generated by fusions of bi-directional transcripts. Nature Communications. 2021, 12(1):4645. (SCI, IF=17.694, Q1, TOP，发现并鉴定了一类新的广泛存在的异链嵌合体RNA)
7. Fang Xu#, Wanqing Du#, Qin Zou#, Yuting Wang#, Xin Zhang, Xudong Xing, Ying Li, Dachuan Zhang, Huimin Wang, Wenhao Zhang, Xinyao Hu, Xin Liu, Xiaoling Liu, Shaojin Zhang, Jinqiang Yu, Jianhuo Fang, Fajin Li, Ying Zhou, Tieqiang Yue, Na Mi, Haiteng Deng, Peng Zou, Xiaowei Chen, Xuerui Yang* and Li Yu*. COPII mitigates ER stress by promoting formation of ER whorls. Cell Research. 2021, 31(2):141-156. (SCI, IF=46.297, Q1, TOP，解析新型内质网应激反应形成ER螺旋效应器)
6. Mingli Zhu#, Qin Zou#, Rongyao Huang, Ying Li, Xudon Xing, Jianhuo Fang, Liang Ma, Lifei Li, Xuerui Yang* and Li Yu*. Lateral transfer of mRNA by migrasomes modifies the recipient cell. Cell Research. 2021, 31(2):237-240. (SCI, IF=46.297, Q1, TOP，揭示新细胞器迁移小体的发生以及关键调控蛋白)
5. Qin Zou, Zhengtao Xiao, Rongyao Huang, Xin Wang, Xun Wang, Haitao Zhao, and Xuerui Yang*. Survey of the translation shifts in hepatocellular carcinoma with ribosome profiling. Theranostics. 2019, 9(14):4141-4155. (SCI, IF=12.400, Q1, TOP，自主优化核糖体图谱方法系统鉴定肝癌翻译组)
4. Yusheng Wu#, Wenwei Zhao#, Yang Liu#, Xiangtian Tan, Xin Li, Qin Zou, Zhengtao Xiao, Hui Xu, Yuting Wang, Xuerui Yang*. Function of HNRNPC in breast cancer cells by controlling the dsRNA-induced interferon response. The EMBO Journal. 2018, 37(23):e99017. (SCI, IF=14.012, Q1, TOP)
3. Yanqing Zhang, Zhengtao Xiao, Qin Zou, Jianhuo Fang, Qifan Wang, Xuerui Yang* and Ning Gao*. Ribosome Profiling Reveals Genome-wide Cellular Translational Regulation upon Heat Stress in Escherichia coli. Genomics Proteomics Bioinformatics. 2017, 15(5):324-330. (SCI, IF=6.409, Q1, TOP)
2. Zhen Lin, Phillip J Hsu, Xudong Xing, Jianhuo Fang, Zhike Lu, Qin Zou, Kejia Zhang, Xiao Zhang, Yuchuan Zhou, Teng Zhang, Youcheng Zhang, Wanlu Song, Guifang Jia, Xuerui Yang*, Chuan He* and Ming-Han Tong*. Mettl3-/Mettl14-mediated mRNA N6-methyladenosine modulates murine spermatogenesis. Cell Research. 2017, 27(10):1216-1230. (SCI, IF=46.297, Q1, TOP)
1. Zhengtao Xiao, Qin Zou, Yu Liu and Xuerui Yang*. Genome-wide assessment of differential translations with ribosome profiling data. Nature Communications. 2016, 7:11194. (SCI, IF=17.694, Q1, TOP)
申请/授权专利
1. 一种基于反向梯度制导的长序列基因密码子靶向优化方法
2. 一种基因同义密码子优化方法、系统、计算机设备及介质
3. 一种原核生物开放阅读框的识别方法、系统、设备及介质
4. 一基于多尺度特征和迁移学习的低资源原核生物ORF预测方法
5. 一种原核生物的重叠阅读框识别方法、系统、设备与介质
6. 一种原核5' UTR的翻译效率预测方法和系统
7. 一种原核5' UTR的半监督语言模型训练方法和系统
8. 一种DNA序列条件生成方法、系统、计算机设备及存储介质
9. 一种DNA序列定向优化方法、系统、计算机设备及存储介质
10. 一种原核启动子识别方法、系统及介质
11. 一种基于跨组学图对齐的基因数据融合方法
承担课程
1. 《人工智能与计算科学》，本科生课程
2. 《基因工程》，本科生课程
3. 《生命科学基础》，本科生课程
4. 《医用生物技术》，本科生课程
5. 《基因工程技术与应用》，研究生课程
6. 《现代分子生物学》，研究生课程
7. 《核酸检测的流程解析及实操》，本科生开放实验项目
8. 《生物医学数据分析可视化》，本科生开放实验项目
9. 《基于核糖体图谱分析的转录组开放阅读框的挖掘》，本科生大创项目
10. 《组学研究高产菌株的调控机制》，本科生大创项目
编写教材
1. 主编《基因工程：原理与技术》，2026年，北京理工大学出版社
2. 参编《生命科学原理》第2版，2025年，北京理工大学出版社
教改项目
1. 北京理工大学研究生教育教学改革项目，2026，主持，在研
2. 北京理工大学本科生教育教学改革项目，2026，主持，在研
3. 北京理工大学研究生教育教学改革项目，2025，主持，已结题
4. 北京理工大学本科生教育教学改革项目，2024，主持，已结题
5. 北京理工大学研究生教育教学改革项目，2023，主持，已结题
发表教改论文
1. 邹沁,马晓焉,孙丽超,陈振娅,肖雯,霍毅欣,郭淑元*.融合人工智能与成果导向教育理念的“基因工程”智慧课程构建与教学实践[J].生物工程学报,2026,42(03):1413-1423.
2. 邹沁,孙丽超,陈振娅,马晓焉,郭淑元*,霍毅欣.BOPPPS教学模式促进研究生批判性思维能力发展研究[J/OL].生物学杂志,1-5[2026-04-27].
3. 邹沁,马晓焉,陈振娅,孙丽超,张桔,郭淑元,霍毅欣*.BOPPPS教学模式的价值引领能力培养研究——以基因编辑技术为例，高校工程教育课程思政联盟论文集.（已接收）
4. 孙丽超,邹沁,马晓焉,陈振娅,霍毅欣*.融合生命科学前沿的思政教学创新实践, 高校工程教育课程思政联盟论文集.（已接收）
5. 孙丽超,马晓焉,陈振娅,邹沁,霍毅欣*.基于学科交叉实施生命科学基础类课程教学改革[J].生物工程学报,2023,39(11):4718-4729.
教育教学研究成果
1. “生”而有翼--生物医获奖成果:药领域高竞争力多元复合型人才培养的路径与实践，获北京理工大学教育教学成果一等奖，2025年校级（研究生类）
2. 延根赓续、自力更“生” ——大国博弈背景下的我国生物学创新人才培养实践，获北京理工大学教育教学成果二等奖，2024年校级（本科生类）
3. 生命科学基础课群，获批北京理工大学聚能课程，2023年校级
奖励荣誉
1. 北京理工大学第四届教师教学创新大赛“四新学科”中级组一等奖（2026年）
2. 北京理工大学第四届教师教学创新大赛“人工智能组”三等奖（2026年）
3. 懋恂•北理第41个教师节暨教师表彰大会教书育人表彰（2025）
4. 北京理工大学2024届本科生毕业设计（论文）重点项目，指导教师，2024年校级
5. 2024年北京理工大学第十四届青年教师基本功大赛三等奖，2024年校级
6. 2023年北京市自然科学一等奖，省部级
指导竞赛获奖
1. 第十四届“挑战杯”中国大学生创业计划竞赛金奖，指导教师，2024年国家级
2. “青创北京”2024年“挑战杯”首都大学生创业计划竞赛金奖，指导教师，2024年省部级
3. 中国国际大学生创新大赛北京赛区高教主赛道三等奖，指导教师，2024年省部级